Presenta un modo RPG que cuenta el inicio de la segunda parte hasta el reencuentro con Sasuke. El plantel aumenta a 62 personajes. Como novedad, hay combates 2 vs 2, en los cuales se realizan ataques combinados (tanto jutsu secreto y especiales, aunque sólo con algunos). Además algunos personajes sufren transformaciones que son irreversibles hasta acabar la batalla. El juego está hablado en japonés tanto en la versión norteamericana como en la europea pero se pueden cambiar los subtítulos.
Análisis:
Ahora unos videos con los jutsus de los personajes:
